MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017229	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
3	NC_017229	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206193
4	NC_017229	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	384206193
5	NC_017229	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
6	NC_017229	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	384206193
7	NC_017229	A	6	6	208	213	100 %	0 %	0 %	0 %	384206193
8	NC_017229	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	384206193
9	NC_017229	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	384206193
10	NC_017229	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
11	NC_017229	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206193
12	NC_017229	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	384206194
13	NC_017229	CTTAA	2	10	369	378	40 %	40 %	0 %	20 %	384206194
14	NC_017229	TAT	3	9	394	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206194
15	NC_017229	A	7	7	428	434	100 %	0 %	0 %	0 %	384206194
16	NC_017229	TAC	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206194
17	NC_017229	T	6	6	602	607	0 %	100 %	0 %	0 %	384206194
18	NC_017229	AAAT	2	8	627	634	75 %	25 %	0 %	0 %	384206194
19	NC_017229	CTG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206194
20	NC_017229	T	7	7	724	730	0 %	100 %	0 %	0 %	384206194
21	NC_017229	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017229	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017229	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017229	AAAC	2	8	830	837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017229	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
26	NC_017229	TCA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
27	NC_017229	TTA	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
28	NC_017229	AGTA	2	8	1085	1092	50 %	25 %	25 %	0 %	384206195
29	NC_017229	TAA	2	6	1137	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
30	NC_017229	ATT	2	6	1143	1148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
31	NC_017229	ATC	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
32	NC_017229	TGT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206195
33	NC_017229	AATA	2	8	1295	1302	75 %	25 %	0 %	0 %	384206195
34	NC_017229	TTC	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206195
35	NC_017229	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
36	NC_017229	TAT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
37	NC_017229	TGTA	2	8	1376	1383	25 %	50 %	25 %	0 %	384206195
38	NC_017229	GAA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206195
39	NC_017229	AATT	2	8	1451	1458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
40	NC_017229	AAC	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206195
41	NC_017229	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
42	NC_017229	TAT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
43	NC_017229	T	7	7	1518	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	384206195
44	NC_017229	CGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206195
45	NC_017229	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
46	NC_017229	ATT	2	6	1669	1674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
47	NC_017229	AATT	2	8	1691	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
48	NC_017229	T	6	6	1733	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	384206195
49	NC_017229	ACAA	2	8	1783	1790	75 %	0 %	0 %	25 %	384206195
50	NC_017229	ATT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
51	NC_017229	T	6	6	1882	1887	0 %	100 %	0 %	0 %	384206195
52	NC_017229	T	8	8	1898	1905	0 %	100 %	0 %	0 %	384206195
53	NC_017229	A	7	7	1913	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	384206195
54	NC_017229	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	384206195
55	NC_017229	TAT	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
56	NC_017229	AT	3	6	1966	1971	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
57	NC_017229	ATT	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
58	NC_017229	ATT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
59	NC_017229	ATTTTT	2	12	2071	2082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206195
60	NC_017229	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
61	NC_017229	TA	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
62	NC_017229	T	6	6	2167	2172	0 %	100 %	0 %	0 %	384206195
63	NC_017229	A	6	6	2233	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017229	TA	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017229	TAAA	2	8	2340	2347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017229	TTATT	2	10	2348	2357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017229	A	7	7	2425	2431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017229	TAAT	2	8	2507	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	384206196
69	NC_017229	A	6	6	2560	2565	100 %	0 %	0 %	0 %	384206196
70	NC_017229	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
71	NC_017229	ATA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
72	NC_017229	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206196
73	NC_017229	GCACCA	2	12	2830	2841	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384206196
74	NC_017229	AT	3	6	2845	2850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206196
75	NC_017229	C	6	6	2869	2874	0 %	0 %	0 %	100 %	384206196
76	NC_017229	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
77	NC_017229	CCAA	2	8	3031	3038	50 %	0 %	0 %	50 %	384206196
78	NC_017229	AC	3	6	3068	3073	50 %	0 %	0 %	50 %	384206196
79	NC_017229	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206196
80	NC_017229	ACA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
81	NC_017229	CAG	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206196
82	NC_017229	T	7	7	3226	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	384206196
83	NC_017229	A	6	6	3260	3265	100 %	0 %	0 %	0 %	384206196
84	NC_017229	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
85	NC_017229	C	6	6	3430	3435	0 %	0 %	0 %	100 %	384206196
86	NC_017229	ACA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
87	NC_017229	TAAAA	2	10	3624	3633	80 %	20 %	0 %	0 %	384206196
88	NC_017229	ATTT	2	8	3692	3699	25 %	75 %	0 %	0 %	384206196
89	NC_017229	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017229	AAC	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017229	TTA	3	9	3806	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017229	ATT	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017229	AT	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017229	TAAAA	2	10	3853	3862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017229	TTAT	2	8	3863	3870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017229	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017229	TATAA	2	10	3884	3893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017229	TAT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017229	AT	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017229	ATT	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017229	TAAAA	2	10	3935	3944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017229	TA	3	6	3956	3961	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
103	NC_017229	AT	3	6	3973	3978	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
104	NC_017229	AGA	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
105	NC_017229	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206197
106	NC_017229	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206197
107	NC_017229	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206197
108	NC_017229	ATA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
109	NC_017229	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206197
110	NC_017229	TTTTA	2	10	4200	4209	20 %	80 %	0 %	0 %	384206197
111	NC_017229	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
112	NC_017229	TTAA	2	8	4267	4274	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
113	NC_017229	ATA	2	6	4285	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
114	NC_017229	A	7	7	4299	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	384206197
115	NC_017229	TAC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206198
116	NC_017229	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
117	NC_017229	TGT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
118	NC_017229	CAC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206198
119	NC_017229	A	7	7	4497	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	384206198
120	NC_017229	GAA	2	6	4509	4514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
121	NC_017229	AAT	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
122	NC_017229	AATG	2	8	4571	4578	50 %	25 %	25 %	0 %	384206198
123	NC_017229	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
124	NC_017229	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
125	NC_017229	GAAA	2	8	4647	4654	75 %	0 %	25 %	0 %	384206199
126	NC_017229	TA	3	6	4665	4670	50 %	50 %	0 %	0 %	384206199
127	NC_017229	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
128	NC_017229	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	384206199
129	NC_017229	TAT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
130	NC_017229	ATT	2	6	4907	4912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
131	NC_017229	A	6	6	4915	4920	100 %	0 %	0 %	0 %	384206199
132	NC_017229	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
133	NC_017229	ATAA	2	8	5026	5033	75 %	25 %	0 %	0 %	384206199
134	NC_017229	AAT	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
135	NC_017229	A	6	6	5070	5075	100 %	0 %	0 %	0 %	384206199
136	NC_017229	CTTT	2	8	5129	5136	0 %	75 %	0 %	25 %	384206199
137	NC_017229	ACA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206199
138	NC_017229	ATT	2	6	5162	5167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
139	NC_017229	CATT	2	8	5183	5190	25 %	50 %	0 %	25 %	384206199
140	NC_017229	TAA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
141	NC_017229	AGA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
142	NC_017229	GAAAA	2	10	5222	5231	80 %	0 %	20 %	0 %	384206199
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